Không như trường Đại học TDTT Tp Hồ Chí Minh, theo Quyết định của Bộ trưởng Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch về quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của trường Đại học TDTT Bắc Ninh, Nhà trường vẫn thực hiện chức năng đào tạo tài năng thể thao.
Theo Quyết định đó (số 3000/QĐ-BVHTTDL), Nhà trường vẫn thực hiện chức năng như Quyết định của Bộ trưởng, Chủ nhiệm Uỷ ban TDTT trước đây (số 106/2004/QĐ-UBTDTT), đó là: Trường Đại học TDTT Bắc Ninh có chức năng đào tạo bồi dưỡng nguồn nhân lực TDTT trình độ đại học, sau đại học, đào tạo tài năng thể thao và tổ chức hoạt động khoa học công nghệ trong lĩnh vực TDTT.
Cũng như trường Đại học TDTT Tp Hồ Chí Minh và trường Đại học TDTT Đà Nẵng, trường Đại học TDTT Bắc Ninh là đơn vị sự nghiệp, trực thuộc Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch mà không phải là tổ chức của Uỷ ban TDTT như trước đây.
Mặc dù không thay đổi về chức năng, song trường Đại học TDTT Bắc Ninh vẫn thực hiện một số nhiệm vụ và quyền hạn mới tương đương với trường Đại học TDTT Đà Nẵng. Theo đó, những nhiệm vụ và quyền hạn của Nhà trường gồm: Xây dựng trang tin điện tử riêng, quản lý và cung cấp các nguồn thông tin khoa học của Trường, tham gia vào hệ thống thông tin chung của các trường đại học, các Bộ, ngành có liên quan; Tự đánh giá chất lượng đào tạo và chịu sự kiểm định chất lượng đào tạo của cơ quan, tổ chức có thẩm quyền; Tổ chức các hoạt động dịch vụ đào tạo, nghiên cứu khoa học phù hợp với chức năng, nhiệm vụ được giao và theo quy định của pháp luật.
Ngoài ra, do thực hiện chức năng đào tạo tài năng thể thao nên Nhà trường cũng sẽ thực hiện các chức năng và nhiệm vụ phù hợp với chức năng đó.
Về cơ cấu tổ chức cơ bản không có gì thay đổi so với trước đây. Và cũng giống như 2 trường Đại học TDTT: Tp Hồ Chí Minh và Đà Nẵng, trường Đại học TDTT Bắc Ninh không còn cơ cấu tổ chức dưới hình thức Hội đồng. Thay vào đó, cơ cấu tổ chức của Nhà trường sẽ gồm: lãnh đạo trường, các phòng chức năng, các khoa, các bộ môn và các tổ chức sự nghiệp.
Hiện tại, Nhà trường vẫn đào tạo 4 khoa: Sư phạm TDTT, Huấn luyện thể thao, Y học TDTT và Quản lý TDTT.
HX