Ngày 8/8/2007, Chính phủ đã ban hành Nghị định 09/2007/NĐ-CP (theo website Chính phủ) về việc chuyển Tổng cục Du lịch vào Bộ Văn hoá - Thể thao và Du lịch. Theo Nghi định đó, Tổng cục Du lịch trực tiếp do Bộ Văn hoá - Thể thao và Du lịch quản lý. Hiện tại, Tổng cục Du lịch tiếp tục thực hiện chức năng, nhiệm vụ quyền hạn và giữ ổn định cơ cấu tổ chức cho đến khi Chính phủ ban hành Nghị định mới quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ, cơ quan ngang Bộ (thay thế Nghị định số 86/2002/NĐ-CP) trong đó có Bộ Văn hóa - Thể thao và Du lịch. Như vậy, Tổng cục Du lịch không còn là cơ quan thuộc Chính phủ (theo Nghị định số 94/2003/NĐ-CP) mà là cơ quan trực thuộc Bộ Văn hoá - Thể thao và Du lịch từ ngày ban hành Nghị định số 09/2007/NĐ-CP.
HX