Xác định TDTT trường học là bộ phận quan trọng của phong trào TDTT nói chung và là một trong những yếu tố của giáo dục toàn diện nhân cách học sinh, chính vì thế thời gian qua công tác giáo dục thể chất và thể thao trong trường học của tỉnh Phú Yên luôn được quan tâm chú trọng. Bên cạnh đó, ngành giáo dục và đào tạo tỉnh Phú Yên tập trung đổi mới chương trình và phương pháp giáo dục thể chất gắn với giáo dục ý chí, đạo đức, sức khỏe và kỹ năng sống cho học sinh.